先天性心脏病在先天畸形中非常常见。随着医疗条件的不断发展，心脏病的诊断和外科治疗技术得到了发展，这使得大多数先天性心脏病可以得到明确的诊断，并通过手术进行积极的纠正治疗，从而可以显著改善先天性心脏病。怀孕两到三个月左右是胎儿心脏和大血管形成的主要阶段。这个时候，如果发生异常，就可能导致先天性心脏病。

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先天性心脏病的病因比较复杂，可能与遗传或环境因素有关。孕妇在怀孕后三个月左右被病毒或细菌感染，尤其是被柯萨奇病毒感染后，生下的孩子可能患有先天性心脏病。

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先天性心脏病还有一些其他原因，比如孕妇羊膜腔穿刺术，或者挤压孕妇肚子里的胎儿，都有可能引发先天性心脏病。如果孕妇在怀孕期间患有营养不良或其他疾病，如糖尿病，也可能导致出生患有先天性心脏病的孩子。

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在某种程度上，先天性心脏病具有某个家族的特征，说明该病可能具有遗传倾向。还有就是父亲或母亲的染色体异常，父亲或母亲的生殖细胞有缺陷，可能导致先天性心脏病。

先天性心脏病有地域差异，也有性别差异。高原地区患先天性心脏病的概率相对较高，男孩患先天性心脏病的概率大于女孩。