衣原体和支原体都属于微生物，但有很多区别:

首先，支原体可以独立生存和繁殖，而衣原体是专性细胞内寄生微生物，不能独立生存和繁殖，即不能在细胞外进行自身代谢；

其次，支原体是不需要在细胞内的最小生物，也是原核生物中最小的一种，而衣原体比支原体略大；

最后，支原体没有细胞壁，只有细胞膜，而衣原体有细胞壁。