免费疫苗和五联疫苗的区别在于:

首先，要预防的疾病不同。联合疫苗是一种主要含有脊髓灰质炎、无细胞百白破、B型流感嗜血杆菌等疫苗的疫苗。免费疫苗主要包括无细胞百白破和脊髓灰质炎灭活疫苗；

其次，五联疫苗和免费疫苗预防的疾病也不同。五联疫苗预防多，比免费疫苗多一个流感嗜血杆菌B预防，需要额外自费接种；

最后，直接给宝宝注射五联疫苗，可以预防疫苗引起的不良反应和疼痛，减少对疫苗的耐药性。