指甲发黄的原因有真菌感染、慢性炎症等。

1.真菌感染:指甲是皮肤的附属物，皮肤癣菌也可引起灰指甲或甲癣，灰指甲较为常见。皮肤癣菌一旦侵入甲板，就会利用甲板上的角质作为营养来源，长此以往会破坏指甲结构，出现指甲变形、变色、分层等症状。灰指甲的颜色变化通常是黄色的。

2.慢性炎症:慢性炎症有时会导致皮肤角蛋白增厚，增厚的角蛋白通常呈黄色或棕黄色。

3.其他原因:指甲长期浸泡在黄色液体中或接触黄色染料物质，局部皮肤会着色，指甲边缘两侧皮肤会变黄。